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萬軍認為醫生不僅僅是治病救人，還需要多關注病人的身體健康和心里感受。他時常對科室的同事們講，要對病人保持耐心、信心，多站在病人的角度上考慮事情，多溝通，清楚了解病人病史，病人心態和家屬心態，這樣治療起來也就得心應手，就不會出現“醫患矛盾”了。
作為胸心胃腸外科主任，萬軍清楚自己重任在肩，為群眾提供優質的診療服務，醫德是基礎，醫術更是關鍵。只有把握好學科建設和專科建設，注重人才培養和技術引進，才能讓科室良性發展。因此，他經常有計劃地選派年輕醫生外出進修學習，不間斷地對年輕醫生進行引導，使得年輕醫生能夠在成長期得到相應的硬件支持和精神支持。
“我們科室基本上都是按照專業組來進行劃分，施行三級審查法，每一個下級醫生都有一個上級醫生帶他，外科醫生的成長更需要上級醫生的支撐。”萬軍說。
但作為科室里的“老前輩”，萬軍也沒有放棄自身的深造，并且十分注重專業技術及相關專業理論知識的學習研究。他擅長普通外科、胸外科常見病多發病及疑難雜癥的診治及危急重癥救治，發表過學術論文多篇。萬軍自己曾在重慶西南醫院普通外科（胃腸微創外科）、重慶醫科大學附屬第一醫院胸外科（胸腔鏡微創手術）進修學習，并源源不斷地把新技術帶回科室。
為了提升科室整體實力，增強醫院服務水平，萬軍更是著眼于不斷地開展新技術、新業務。在他的帶領下，科室成功開展了胸腔鏡下縱隔腫瘤切除術、胸腔鏡下食管良性腫瘤切除術、胸腹腔鏡聯合（三切口）食管癌根治術、胸腔鏡下肺葉切除術、CT引導下經皮肺穿刺活檢術等技術，科室胸腔鏡微創診療技術的應用發展，讓患者的健康更加有保障。
